MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015850	CGA	2	6	1250855	1250860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015850	CCG	2	6	1250881	1250886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_015850	CG	3	6	1250915	1250920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015850	T	6	6	1251026	1251031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015850	CTC	2	6	1251042	1251047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_015850	CCA	2	6	1251228	1251233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_015850	TGC	2	6	1252537	1252542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015850	AACC	2	8	1252556	1252563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_015850	ACCA	2	8	1252566	1252573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_015850	CA	3	6	1252607	1252612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_015850	CCG	2	6	1254166	1254171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_015850	GCC	2	6	1254225	1254230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_015850	CTA	2	6	1254287	1254292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015850	CAGGG	2	10	1254329	1254338	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3015	NC_015850	CG	3	6	1254363	1254368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_015850	GCG	2	6	1254391	1254396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015850	GGGT	2	8	1254414	1254421	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015850	A	7	7	1254431	1254437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015850	AAAAG	2	10	1254532	1254541	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015850	CAA	2	6	1254544	1254549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015850	GGA	2	6	1254562	1254567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015850	ATG	2	6	1255287	1255292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015850	CCT	2	6	1255293	1255298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_015850	T	6	6	1255298	1255303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015850	CG	3	6	1255327	1255332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_015850	CG	3	6	1255341	1255346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_015850	CCT	2	6	1257656	1257661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_015850	CAGA	2	8	1257668	1257675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_015850	CACC	2	8	1257692	1257699	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3030	NC_015850	CCG	2	6	1257718	1257723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_015850	GCC	2	6	1257780	1257785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_015850	GCC	2	6	1257795	1257800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_015850	CAA	2	6	1257828	1257833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015850	C	6	6	1258218	1258223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3035	NC_015850	TGG	2	6	1258232	1258237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015850	CCA	2	6	1258246	1258251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_015850	CGGA	2	8	1258285	1258292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_015850	A	6	6	1259496	1259501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015850	A	6	6	1259582	1259587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015850	TGT	2	6	1259660	1259665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015850	TCG	2	6	1260894	1260899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015850	CAT	2	6	1260938	1260943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_015850	TGG	2	6	1265573	1265578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015850	ATGC	2	8	1267677	1267684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_015850	CT	3	6	1267809	1267814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_015850	GCA	2	6	1267839	1267844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015850	CCG	2	6	1267918	1267923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_015850	TGG	2	6	1267929	1267934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015850	CCA	2	6	1267959	1267964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_015850	CGC	2	6	1267966	1267971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_015850	GCCTTT	2	12	1267972	1267983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015850	TGCC	2	8	1267988	1267995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_015850	GGT	2	6	1268061	1268066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015850	AGC	2	6	1268084	1268089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015850	ACA	2	6	1268098	1268103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015850	CA	3	6	1268102	1268107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_015850	TCC	2	6	1268568	1268573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_015850	CGC	2	6	1268657	1268662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_015850	G	6	6	1268673	1268678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015850	TCCAT	2	10	1268684	1268693	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3061	NC_015850	CTC	2	6	1271315	1271320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_015850	GCT	2	6	1271321	1271326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015850	G	6	6	1271348	1271353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015850	CCG	2	6	1272503	1272508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_015850	CTCA	2	8	1272519	1272526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_015850	GTC	2	6	1272607	1272612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015850	T	6	6	1272688	1272693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015850	CG	3	6	1272729	1272734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_015850	GAA	2	6	1272799	1272804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015850	CGTC	2	8	1272833	1272840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_015850	ATC	2	6	1272936	1272941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015850	AC	3	6	1272957	1272962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_015850	ACC	2	6	1273193	1273198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_015850	CTT	2	6	1273337	1273342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_015850	TCGC	2	8	1273345	1273352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_015850	GCG	2	6	1273387	1273392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_015850	TCT	2	6	1273447	1273452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015850	AGA	2	6	1273455	1273460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015850	ATC	2	6	1273528	1273533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015850	GCC	2	6	1273848	1273853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_015850	ATG	2	6	1274717	1274722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015850	GGTA	2	8	1274729	1274736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015850	CGA	2	6	1274755	1274760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_015850	ACC	2	6	1274774	1274779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_015850	ATCC	2	8	1274872	1274879	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_015850	T	6	6	1274894	1274899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015850	GATCA	2	10	1274908	1274917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3088	NC_015850	AGG	2	6	1274958	1274963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015850	GCA	2	6	1278541	1278546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015850	CCA	2	6	1278584	1278589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_015850	CCAG	2	8	1278944	1278951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_015850	TCC	2	6	1280274	1280279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_015850	AGCG	2	8	1282466	1282473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_015850	CGC	2	6	1282518	1282523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_015850	TCC	2	6	1282816	1282821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_015850	ACAAA	2	10	1282824	1282833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_015850	GTGG	2	8	1282835	1282842	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015850	CCAC	2	8	1282849	1282856	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3099	NC_015850	CTC	2	6	1284024	1284029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_015850	AT	3	6	1285139	1285144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015850	ATA	2	6	1285230	1285235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015850	TCC	2	6	1285248	1285253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_015850	CTT	2	6	1285278	1285283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015850	CGC	2	6	1285292	1285297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_015850	GA	3	6	1285338	1285343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015850	TAT	2	6	1285351	1285356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015850	ATT	2	6	1285379	1285384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015850	CTC	2	6	1291897	1291902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_015850	CCT	2	6	1294099	1294104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_015850	TCCCC	2	10	1294542	1294551	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3111	NC_015850	TGGTG	2	10	1294640	1294649	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015850	CAGG	2	8	1294760	1294767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_015850	TCT	2	6	1296694	1296699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015850	GC	3	6	1296722	1296727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_015850	TCG	2	6	1296734	1296739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015850	GCACG	2	10	1296772	1296781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3117	NC_015850	CT	3	6	1296791	1296796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_015850	CTT	2	6	1296821	1296826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_015850	GGT	2	6	1296836	1296841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015850	CATTT	2	10	1299121	1299130	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_015850	GCG	2	6	1299136	1299141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015850	CAA	2	6	1299165	1299170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015850	TGC	2	6	1299330	1299335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015850	C	6	6	1299335	1299340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3125	NC_015850	TGG	2	6	1299413	1299418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015850	T	6	6	1299459	1299464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015850	GCTTG	2	10	1299509	1299518	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3128	NC_015850	GTCC	2	8	1299548	1299555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_015850	GCA	2	6	1299730	1299735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015850	ACTGGA	2	12	1299762	1299773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3131	NC_015850	ATTG	2	8	1299803	1299810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015850	GGGA	2	8	1299848	1299855	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015850	TAC	2	6	1299866	1299871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_015850	CAG	2	6	1299936	1299941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_015850	CCA	2	6	1299969	1299974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3136	NC_015850	CAA	2	6	1299981	1299986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_015850	TTTA	2	8	1300029	1300036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_015850	GTA	2	6	1300256	1300261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3150	NC_015850	CCA	2	6	1302550	1302555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_015850	A	6	6	1302604	1302609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_015850	CTG	2	6	1302626	1302631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_015850	AC	3	6	1302680	1302685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_015850	GTCG	2	8	1302784	1302791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3159	NC_015850	CGTTC	2	10	1302910	1302919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3163	NC_015850	TTC	2	6	1305800	1305805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3168	NC_015850	GC	3	6	1308878	1308883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3169	NC_015850	CG	3	6	1308897	1308902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3262	NC_015850	AGG	2	6	1362361	1362366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3380	NC_015850	TGTCC	2	10	1437585	1437594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3381	NC_015850	AATG	2	8	1437601	1437608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_015850	CT	3	6	1440090	1440095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3383	NC_015850	GGAG	2	8	1440110	1440117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3386	NC_015850	T	8	8	1440200	1440207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_015850	CCA	2	6	1440639	1440644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3388	NC_015850	GGT	2	6	1440657	1440662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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